Khi người bệnh được chỉ định nhập viện điều trị nội trú, ngoài việc đảm bảo chất lượng chuyên môn là cao nhất thì Bệnh viện Đại học Y Dược TPHCM - Cơ sở 2 còn xây dựng hệ thống phòng ốc đáp ứng nhu cầu dịch vụ của người bệnh với giá cả hợp lý. Tất cả các phòng nội trú được thiết kế an toàn và đầy đủ tiện nghi.

Những tiện nghi chung của các phòng bệnh
Các phòng nội trú của bệnh viện bao gồm:
-  Máy lạnh, Tivi, tủ lạnh, điện thoại gọi nội bộ và có thể gọi ra ngoài
-  Phòng tắm đầy đủ tiện nghi (có máy nước nóng, vòi sen)
-  Ghế nằm dành cho người nhà, thân nhân người bệnh
-  Tủ để đồ dùng cá nhân

- Phòng 1 giường ; Phòng 2 giường ; Phòng 3 giường...

- Phòng được thiết kế thông thoáng, yên tỉnh, phù hợp cho việc nghỉ ngơi và điều trị bệnh

Các Khoa/Đơn vị điều trị Nội trú tại bệnh viện

- Khoa Tai Mũi Họng

- Khoa Phụ sản

- Khoa Ngoại Tổng hợp

- Đơn vị Chấn thương chỉnh hình